2008年北京奧運(yùn)會期間，公司高標(biāo)準(zhǔn)地完成了彩排、開閉幕式和賽事期間運(yùn)送乘客的任務(wù)，創(chuàng)造了連續(xù)安全運(yùn)營45小時(shí)的最長紀(jì)錄，承擔(dān)了奧運(yùn)主場館區(qū)80%的人員疏散任務(wù)，成為奧運(yùn)交通運(yùn)輸保障的骨干力量。公司的出色業(yè)績，被中共中央、國務(wù)院授予“北京奧運(yùn)會、殘奧會先進(jìn)集體”榮譽(yù)稱號。

　　落實(shí)胡總書記指示  市民出行首選地鐵

　　2008年6月和2009年10月，胡錦濤總書記先后兩次視察北京地鐵。胡總書記指出：要解決好城市交通問題，必須充分發(fā)揮公共交通的重要作用，特別要發(fā)揮軌道交通的作用，為廣大市民提供快捷、安全、方便、舒適的公交服務(wù)。

　　2009年春天，公司提出“踐行科學(xué)發(fā)展觀，建設(shè)‘六型地鐵’”的學(xué)習(xí)實(shí)踐活動(dòng)主題。公司第14次縮短列車運(yùn)行間隔，1號線為2分15秒，2號線達(dá)到2分鐘，達(dá)到國內(nèi)領(lǐng)先，世界一流水平。北京市委書記劉淇批示：“地鐵運(yùn)營公司積極主動(dòng)應(yīng)對挑戰(zhàn)，技術(shù)改造加管理創(chuàng)新，使生產(chǎn)效率大幅度提高，這是企業(yè)科學(xué)發(fā)展的好經(jīng)驗(yàn)。應(yīng)予表揚(yáng)和推廣”。

　　公司深化內(nèi)部體制改革，組建了3個(gè)運(yùn)營分公司，變專業(yè)化管理為綜合性管理。2009年7月，《北京地鐵公司2009—2015年發(fā)展規(guī)劃》正式頒布實(shí)施。2009年11月，北京地鐵車輛裝備有限公司改制組建。自主研發(fā)的具有完全自主知識產(chǎn)權(quán)的B型車將投入房山線試運(yùn)營。

　　2009年金秋，公司以“超奧運(yùn)標(biāo)準(zhǔn)”，完成了國慶慶典彩排等運(yùn)輸任務(wù)，實(shí)現(xiàn)了“絕對安全、萬無一失”的目標(biāo)。出色的業(yè)績也使公司榮膺第四屆“北京影響力——影響百姓經(jīng)濟(jì)生活的十大企業(yè)”稱號。

　　2010年底，公司接收亦莊線、房山線、昌平線和15號線一期4條新線，運(yùn)營里程增至289公里，163座車站。